L'entreprise fut fondée à Genève en 1839 par le Polonais Antoine Norbert de Patek (1812-1877) et l'horloger tchèque François Czapek né le 4 avril 1811 au village de Semonice. Antoine Norbert de Patek avait fui la Pologne et était arrivé à Genève. Les deux associés étant en désaccord croissant, Czapek céda sa place à l'ingénieur français Jean Adrien Philippe que Patek rencontra en 1844 à l'Exposition Universelle de Paris. C'est cet ingénieur qui avait inventé une montre de poche facilement remontable (par une couronne) et c'est aussi lui qui adapta le pantographe au besoin de l'entreprise pour la fabrication de montres. En 1845 la maison Patek Czapek et dissoute ; Antoine Norbert de Patek, Jean Adrien Philippe et Vincent Gostowski fondent à Genève la Société Patek et En 1851, les trois hommes changent la raison sociale en Patek Philippe & c'est la que la marque fut reprise par la famille Stern en 1932 qui en est toujours propriétaire
Patek Philippe est spécialisée dans l'horlogerie de très haute qualité. La firme est l'une des rares à avoir archivé les coordonnées de tous ses clients depuis le début de son activité. Ils ont créé beaucoup de nouveautés telles que la montre bracelet pour femme, ou encore les montres à remontoirs (faciles à remonter). Depuis 1845, elle a déposé plus de 70 brevets
- 1881 : régulateur de précision
- 1889 : mécanisme du quantième perpétuel ;
- 1902 : double chronographe ;
- 1949 : balancier Gyromax (en) ;
- 1959 : montres mécaniques à fuseaux horaires ;
- 1964 : mouvement mécanique avec rotor périphérique ;
- 1985 : mécanisme indicateur de la date de Pâques ;
- 1996 : quantième annuel ;
- 2000 : mécanisme de représentation astronomique.
Autrefois sise à Genève, l'entreprise a regroupé toutes ses activités dans la périphérie genevoise, à Plan-les-Ouates et à Perly ainsi qu'à la Chaux-de-Fond